什么是LNA
LNA 是新型的核酸類似物,它包含了2'-氧4' 碳亞甲基連接,這個(gè)連接限制了呋喃核糖環(huán)的靈活性,因而將其結(jié)構(gòu)鎖定成一個(gè)剛性的雙環(huán)模式,因此而提高雜交效率和*的穩(wěn)定性。
LNA 熒光探針優(yōu)點(diǎn):
1.增強(qiáng)熱穩(wěn)定性和雜交的特異性
對(duì)實(shí)時(shí)定量PCR探針提出LNA化學(xué)產(chǎn)品增強(qiáng)雙鏈體的熱穩(wěn)定性,同時(shí)加強(qiáng)對(duì)目標(biāo)序列雜交的特異性。因此,由非所需激活的熒光背景將大量減少,從而使信號(hào)對(duì)背景噪音的比例增大。
LNA 單分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)決定了其探針與目標(biāo)序列雜交后的穩(wěn)定性,與普通的DNA熒光探針相比,其雙鏈在相同的鹽溶液中,每增加一個(gè)單體LNA分子將導(dǎo)致其熔點(diǎn)提升8°C。強(qiáng)化后的雜交性能可以顯著的擴(kuò)大實(shí)驗(yàn)檢測(cè)的環(huán)境限制,同時(shí)允許在單試管中進(jìn)行更復(fù)雜的試驗(yàn)??梢酝ㄟ^調(diào)整LNA堿基在探針中的位置來(lái)調(diào)節(jié)*熔點(diǎn)(Tm)和雜交的特異性。
2.更易及靈活的探針設(shè)計(jì)來(lái)檢測(cè)有問題的目標(biāo)序列
由于LNA 強(qiáng)化的雜交特征和對(duì)熔點(diǎn)溫度的影響,含有LNA的實(shí)時(shí)定量PCR探針,長(zhǎng)度較短,可以增加設(shè)計(jì)的靈活性,同時(shí)附和檢測(cè)設(shè)計(jì)的指南。因此普通DNA探針某些設(shè)計(jì)的局限或無(wú)法解決的問題都可被減少或消除。
例如, 含大量AT的實(shí)時(shí)定量PCR探針通常需要30堿基以上(有時(shí)超過40堿基)來(lái)達(dá)到擴(kuò)增設(shè)計(jì)的指南,但是可能效果較差。LNA熒光探針的應(yīng)用可靈活選擇LNA的位置,以達(dá)到高特異性的設(shè)計(jì),短的探針可以很有效的工作,甚至短到13到20個(gè)堿基。
3.適用于多種實(shí)時(shí)定量PCR 系統(tǒng)
LNA 熒光探針適用于多種實(shí)時(shí)定量PCR 系統(tǒng),這基于染料和設(shè)備的激發(fā)/發(fā)射的波長(zhǎng)。這為您提供在固定的周期實(shí)驗(yàn)環(huán)境下自由的選擇儀器與試劑系統(tǒng)的組合。這無(wú)需額外的資本投入。